Принимайте и оплачивайте только тот объем работ, который подрядчик выполнил по контракту

Заказчики закладывают в смету резерв средств на непредвиденные работы и затраты при проведении подрядных работ. Он не должен превышать размер, который предусмотрен сметной документацией по объекту. Резерв средств на непредвиденные работы и затраты предназначен для возмещения стоимости работ и затрат, потребность в которых возникает в процессе разработки рабочей документации или в ходе строительства в результате уточнения проектных решений или условий строительства или реконструкции объектов капитального строительства.
п. 21 Порядка приказа Минстроя от 23.12.2019 № 841/пр

21. НМЦК на выполнение подрядных работ по строительству, реконструкции, капитальному ремонту, сносу объектов капитального строительства, работ по сохранению объектов культурного наследия (памятников истории и культуры) народов Российской Федерации, а также строительству некапитальных строений и сооружений определяется с учетом затрат на работы и услуги, относящиеся к предмету закупки, предусмотренные сводным сметным расчетом стоимости строительства в составе утвержденной проектной документации, получившей положительное заключение экспертизы проектной документации.

При этом резерв средств на непредвиденные работы и затраты определяется заказчиком в размере, не превышающем размер, предусмотренный сметной документацией по объекту.